L’épidémiologie analytique cherche à comparer l’état de santé entre différentes populations afin de déterminer une liaison significative entre un facteur de risque et une pathologie. Dans les études cas-témoins, la construction des 2 groupes (cas et témoins) est critique et doit respecter à la fois l’appariement (faire correspondre à chaque cas un témoin comparable) et la stratification (construire un groupe dont le la distribution des caractéristiques est comparable). Or dans le cas des études "écologiques" le groupe est formé "géographiquement", ce qui peut induire des facteurs de confusion, sachant que les personnes les plus pauvres vivent aussi sur les lieux les plus pollués il est des fois difficile de discriminer l’effet de l’environnement physique : la pollution, de l’effet de l’environnement social : la pauvreté.