Les études écologiques de types « cas-témoins » s’écartent souvent des règles de l’épidémiologie parce qu’elles présentent un risque de biais de sélection des sujets, il peut y avoir aussi des erreurs de classification par rapport à l’exposition (exemple du statut d’auto déclaration), il y a aussi le risque de biais de confusion qui peut être important et les données peuvent ne pas être adaptées à une utilisation épidémiologiques. Tout ce ceci représente des inconvénients pour mener une bonne étude épidémiologique