Le problème de la diffusion des médicaments pose problème sur le plan environnemental en raison de ses impacts sur l’écosystème. Des traces médicamenteuses sont trouvées dans les milieux aquatiques et les sols provenant de la STEP. Certaines substances peuvent avoir un impact significatif sur la faune et la flore. La préoccupation est le devenir de ces médicaments dans l’environnement et la modification qu’ils apportent lors de son interaction avec l’environnement. Les conséquences écologiques à long terme, le cycle de vie et les mécanismes d’action des médicaments ou ses métabolites sont à traiter.