La question de la diffusion des médicaments devient un sujet grandissant d’inquiétude car :
la pollution est large et difficile à maîtriser : on trouve des traces de médicaments dans les eaux superficielles et souterraines, dans les eaux résiduaires, dans les boues des stations d’épuration utilisées en épandage agricole et dans les sols, et même dans l’eau potable.
Les effets chroniques dépassent très certainement les effets aigus et on suspecte des effets additifs ou synergiques lorsque ces substances sont associées en mélange.
Il est admis que les composés chimiques montrant une activité ostrogénique ou androgénique présents dans l’environnement peuvent affecter la reproduction et le développement des invertébrés
Les écosystèmes terrestres sont particulièrement affectés par le biais de l’épandage des boues sur le sol. Certains produits peuvent s’accumuler et se concentrer dans la chaîne alimentaire et exposer immédiatement les animaux et les hommes.
Surtout, les antibiotiques rejetés en continu agissent sur la microflore en perturbant l’activité bactérienne et en créant des résistances parmi les bactéries environnementales. Ce transfert d’antibiorésistance est un risque jugé majeur.