L’excrétion est la principale source d’émission, ensuite la diffusion a lieu via les eaux usées vers des stations d’épuration ou des fosses septiques. La contamination des sols est également un facteur déterminant dans la diffusion des médicaments dans l’environnement surtout en cas d’épandage de boues d’épurations comme dans le cadre de la valorisation agricole.