L’élimination des médicaments par les effluents pose le problème des IPA rejetés par les utilisateurs des médicaments (malades, médecins, vétérinaires, agriculteurs…) pour lesquels les rejets de métabolites n’est pas évitables par opposition aux déversements volontaires qui peut théoriquement être évité. En effet la réduction à la source en maîtrisanst les médicaments usagés, ou les déchets hospitaliers ne peut être évitée. Ce qui pose le problème de la maîtrise des rejets De la même manière, une fois rejettés dans les effluents, les systèmes d’épuration sont incapables d’extraire ces IPA. Même si les STEP arrivent à extraire ces IPA, l’utilisation des boues d’épuration en agriculture devrait les renvoyer dans l’environnement ; un cercle vicieux difficile à éliminer.