Une meilleure connaissance du cycle de vie des substances médicamenteuses dans l’environnement est indispensable pour mieux suivre les conséquences de leurs utilisations et de leurs rejets. Les enjeux de ce risque concernent non seulement la protection de l’environnement et en particulier le bon état des milieux aquatiques et des ressources en eau, mais aussi la santé publique. La complication présente dans le traitement des résidus médicamenteux est liée principalement à la difficulté de leur dégradation dans la nature, donc leur passage dans différentes milieux et leur accumulation dans les êtres vivants. Un autre enjeu est lié particulièrement au coût des technologies de traitement des déchets médicamenteuses et les eaux résiduaires industrielles ou urbaines. Les couts élevés de traitement peut présent un obstacle dans la lute contre ce type de pollution.