Les limites principales des deux études ExternE sont :
1- Utilisation des valeurs moyennes pour la concentration des polluants dans les modèles de transmission et d’exposition. Ce fait néglige la possibilité d’accumulations ponctuelles et momentanées et leurs conséquences éventuelles à la fois sur la santé et l’environnement
2- La difficulté de traiter des accidents très peu probables car en premier lieu il faut comparer entre les risques d’accidents liés à chacune des filières. Ainsi raisonner avec une méthode faisant appel aux courbes d’indifférence entre les gains en termes de revenus et le risque d’accident et donc mettre au point une autre approche – spécifique pour le traitement des accidents