L’agrégation à travers une solution théorique suppose en tout état de cause que les composantes du coût soient des variables indépendantes. Cette indépendance supposée des effets des polluants peut ne pas être vérifiée. Par exemple, la sensibilité au NOx et donc le dommage occasionné à l’organisme par ce polluant ne soient pas indépendants de la présence d’un autre polluant comme les SOx. Aussi les coûts externes sont soit dérivés de systèmes de prix soit forgés à partir de méthodes de substitution.