La différence clé entre les deux termes est la suivante :
Xénobiotique : substance étrangère à l’organisme, mais cela ne signifie pas nécessairement qu’elle est toxique.
Toxique : une substance qui a des effets néfastes sur un organisme vivant.

Pour donner une image plus claire :
un xénobiotique désigne toute substance étrangère à l’organisme, mais cela ne signifie pas nécessairement qu’elle est toxique. Toutefois, sa nature inconnue peut susciter des doutes quant à son innocuité. Lorsqu’une telle substance pénètre dans le corps, ce dernier mobilise en priorité ses défenses contre les agents familiers, car le système immunitaire est principalement conçu pour réagir aux menaces déjà identifiées.
Un toxique désigne la capacité d’une substance à provoquer des effets néfastes sur un organisme vivant. Elle peut provoquer des maladies, des lésions ou même la mort.