L’agrégation des coûts externes selon les sources de pollution pour obtenir un coût externe global d’un combustible peut introduire des biais en raison du risque de double comptage des effets, de la difficulté à pondérer correctement les coûts, de l’hétérogénéité des impacts, de la variabilité géographique, de la simplification excessive et des problèmes de comparabilité entre différentes sources. Pour minimiser ces biais, il est souvent recommandé de mener des évaluations spécifiques pour chaque source de pollution afin de mieux comprendre les coûts externes associés à chaque combustible, tout en évitant les problèmes potentiels liés à une agrégation globale simpliste.