Il y a quelques raisons pour s’adresser cet inconvénient :
 Ces études ne peuvent pas de contrôler les facteurs de confusion, par exemple : l’âge, le sexe, le tabagisme, l’alimentation, etc. qui peuvent influencer les résultats.
 Les données sur l’exposition et les résultats sont souvent agrégées au niveau de la population, qui peut masquer les différences individuelles et les variations géographiques.
 Ces études peuvent être sujettes à des biais de sélection, lorsque les cas et les témoins ne sont pas appariés individuellement, mais plutôt sélectionnés en fonction de leur appartenance à une population exposée ou non exposée.
 Ces études peuvent être influencées par des biais de mesure, car les données sur l’exposition et les résultats peuvent être inexactes ou incomplètes.