La présence des médicaments dans l’environnement pose des problèmes pour les écosystèmes du fait par les limites technologiques et biologiques des traitements des eaux usées produites en partie des déjections des êtres humains qui sont consommateurs de médicaments pour maintenir leur santé.
L’écoulement des eaux traitées à la sortie des stations épurations comporte des eaux vecteurs de produits actifs non éliminé des certains médicaments et qui vont contaminer l’eau des rivières, ensuite la faune et la flore même si les espèces ont des protections plus ou moins adaptés et différentes entre elles.

L’environnement subira et consommera les produits actifs des médicaments (IPA= ingrédients pharmaceutiques actifs) que ça soit dans les rivières, la terre. Les conséquences seraient des pathologies infectieuses ou la diminution des défenses immunitaires des êtres vivants moins résistants dans l’environnement.
Le problème suivra d’ordre sanitaire pour les êtres humains car la consommation des animaux d’élevages et des légumes produites par l’agriculture.