L’accumulation des médicaments dans les effluents pose avec acuité le problème de traitement et d’élimination d’une plus grande diversité d’ingrédients pharmaceutiques actifs dans les eaux et avant l’épandage. Déjà, l’élimination des molécules ou métabolites dans le cadre de la règlementation européenne génère des coûts sociaux énormes et nécessiterait des technologies de pointe. A terme, un dilemme serait la mise en œuvre de procédures technologiques avancées pour le traitements des déchets médicamenteux contenus dans les effluents moyennant une plus grande taxation des citoyens déjà assez taxés pour prévenir l’apparition de pathologie ou le développement de nouvelles pathologies ou alors laisser apparaitre les pathologies et les traitées. En d’autres termes, le dilemme qui se poserait aux pouvoirs publiques serait l’option de retraitement du contenu des effluents à des coûts sociaux élevés ou le traitement des pathologies liées aux contaminations possibles dues aux contenus des effluents.