Les médicaments ont pour but de traiter les maladies, cependant une fois utilisés, la diffusion des IPAs dans les déchets pose problème. Pour les effluents industriels, il est possible d’améliorer la gestion des rejets à travers l’application des procédures et codes environnementaux régissant les industries. Ce qui n’est pas le cas des effluents domestiques, qui sont cependant les plus importants car c’est l’excrétion qui est la principale source d’émission d’IPA. L’extraction des IPAs des eaux usées par des systèmes d’épuration est incomplète. Par exemple : les boues d’épuration, utilisés malgré tout pour l’agriculture, peuvent stocker une quantité considérable d’IPAs.

La gestion des risques demeurent un dilemme pour le pouvoir public car :

 il est quasi impossible d’interdire ou de limiter les substances pouvant polluer les eaux/sédiments une fois excréter. Les médicaments

 la quantité excrétée par une population ainsi que la diffusion d’un médicament sont considérablement variable et rend la gestion des risques plus difficile. Les différentes études ne permettent pas leur évaluation exacte des risques encourues.