Le problème majeur des IPA est leur devenir dans l’environnement : Les médicamenteuses sont conçues pour traiter les affections mais leur devenir dans l’environnement n’a pas été pris au sérieux quand depuis sa mise en vente jusqu’à son utilisation aux niveaux des hôpitaux ou des patients particuliers traiter à domicile, les ménages en particulier méconnaissent les dangers que représentent le rejet des médicaments dans la nature.
Les substances des médicaments qui se trouvent dans les eaux usées ou les sanitaires présentent un risque même après un traitement dans les stations d’épuration, car les boues contenants ses substances peuvent servir d’épandage en agriculture.